Senior Bioinformatik-Analyst (m/w/d) | Remote mit AWS & NGS-Expertise

Wir suchen einen erfahrenen Bioinformatiker oder Datenwissenschaftler, der unser dynamisches Team verstärkt. In dieser Position arbeiten Sie an vielfältigen Projekten und setzen Ihre Expertise in Bioinformatik und Datenwissenschaft ein, um komplexe wissenschaftliche Herausforderungen zu bewältigen. Sie entwickeln modernste Berechnungsmethoden und Algorithmen, die unseren Kunden wertvolle Erkenntnisse aus ihren Daten ermöglichen. Hauptaufgaben - Entwicklung maßgeschneiderter bioinformatischer Lösungen in enger Zusammenarbeit mit Kunden, um deren spezifische Forschungsziele zu verstehen und optimale Analysewege zu definieren. - Kollaboration mit interdisziplinären Teams aus Biologen, Genetikern und Datenwissenschaftlern zur Erarbeitung effektiver Berechnungsstrategien für großvolumige biologische Datensätze. - Konzeption und Implementierung leistungsfähiger Rechenpipelines für diverse biologische Datentypen, einschließlich Genomik, Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik. - Federführende Beteiligung an der Entwicklung, Bereitstellung und Optimierung bioinformatischer Workflow-Pipelines für NGS-Daten (Einzelzell- und Bulk-RNA-seq), sowie fundierte Interpretation der generierten Ergebnisse. - Durchführung anspruchsvoller statistischer Analysen und Data-Mining-Verfahren zur Identifikation relevanter Muster, Korrelationen und Biomarker. - Anwendung fortschrittlicher statistischer Modellierungs- und Machine-Learning-Techniken zur Ableitung prädiktiver Modelle aus komplexen Datensätzen. - Kontinuierliche Weiterbildung zu aktuellen Entwicklungen in der Bioinformatik und aktive Mitgestaltung bei der Verbesserung bestehender Methoden und Algorithmen. - Prägnante und zielgruppengerechte Präsentation von Erkenntnissen und Ergebnissen für interne Teams und externe Stakeholder. - Bereitstellung und Optimierung spezialisierter bioinformatischer Workflows für die Integration und Analyse von Short- und Long-Read-Sequenzierungsdaten. - Durchführung umfassender Qualitätskontrollprüfungen, präzises Alignment von Probendaten mit dem Referenzgenom und Erstellung validierter Variant Called Files (VCFs) sowie Joint-Genotyped VCF-Dateien. - Entwicklung maßgeschneiderter Algorithmen für spezifische genomische Fragestellungen. Anforderungsprofil - Abgeschlossenes Studium (B.Sc. oder M.Sc.) in einem relevanten Fachbereich (Informatik, Bioinformatik, Computational Biology) mit nachweislicher praktischer Erfahrung in der NGS-Workflow-Entwicklung und -Analyse. - Fundierte Erfahrung mit GxP-Standards, Genedata Selector und NGS-Anwendungen im Bereich der Zelltherapie ist unabdingbar. - Umfassendes Verständnis bioinformatischer Konzepte, Algorithmen und Tools sowie deren praktische Anwendung. - Nachgewiesene Expertise in der Analyse von Hochdurchsatz-Genomik-, Transkriptomik- oder Proteomik-Daten. - Mehrjährige praktische Erfahrung mit der Erstellung und Optimierung von Pipelines zur Verarbeitung von Einzelzell- und Bulk-RNA-seq-Daten. - Ausgeprägte Kompetenz in der Pipeline-Entwicklung mit aktuellen Frameworks wie Nextflow (22.10+), Cromwell oder vergleichbaren Systemen. - Vertiefte Erfahrung mit Python (3.9+) sowie fundierten Kenntnissen relevanter bioinformatischer Bibliotheken und Frameworks (BioPython, Pandas, NumPy, SciPy). - Souveräne Beherrschung statistischer Analyseverfahren, Machine-Learning-Techniken und Data-Mining-Methoden für biologische Datensätze. - Englischkenntnisse auf mindestens C1-Niveau für die effektive internationale Kommunikation. Wünschenswerte Qualifikationen - Vertiefte Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten und fortgeschrittenen Variant-Calling-Methoden. - Fundierte Kenntnisse in Strukturbioinformatik und molekularer Modellierung für integrative Datenanalysen. - Praxiserfahrung mit Cloud-Computing-Plattformen (insbesondere AWS EC2, S3, Batch, Lambda) und Big-Data-Analyse-Frameworks (Spark, Hadoop). - Nachweisliche Erfahrung mit der Bereitstellung und Skalierung von Pipelines in AWS-Umgebungen. - Vertrautheit mit Container-Technologien (Docker, Kubernetes) zur Gewährleistung reproduzierbarer bioinformatischer Analysen. - Ausgeprägte kommunikative Fähigkeiten und Talent zur verständlichen Vermittlung komplexer Konzepte an nichttechnische Stakeholder. Warum Sie bei uns arbeiten sollten Als Teil unseres innovativen Teams arbeiten Sie an der Spitze der genomischen Forschung und leisten einen bedeutenden Beitrag zur Weiterentwicklung der Bioinformatik. Wir bieten eine flexible, überwiegend ortsunabhängige Arbeitsumgebung mit Zugang zu modernsten Technologien und die Möglichkeit, mit führenden Wissenschaftlern zu kollaborieren. Ihre Arbeit hat direkten Einfluss auf die Entwicklung innovativer Lösungen in der Präzisionsmedizin und personalisierten Gesundheitsversorgung – eine seltene Chance, Ihre technische Expertise mit echter wissenschaftlicher Wirkung zu verbinden.